Preguntas Frecuentes LANEM-IQ

Preguntas Frecuentes

Laboratorio de LANEM-IQ

¿A quién contacto para solicitar información sobre un servicio?

Para solicitar información puedes contactar al responsable del LANEM, la Dra. Adela Rodríguez Romero, ya sea por teléfono (55 56 22 45 68) o por correo (adela@unam.mx). Asegúrate de tener a la mano los datos solicitados en la sección de “Procedimiento para la solicitud de Servicio”.

¿Qué cantidad de material necesito para poder obtener la estructura de mi proteína?

La respuesta a esta pregunta es dependiente de cada caso en particular. Sin embargo, pruebas iniciales de cristalización pueden realizarse con 1-2 mg de proteína muy pura.

¿Qué características debe tener mi muestra para poder usarla para cristalografía de rayos X?

• La proteína debe ser fresca. Si es posible no debe tener más de un día de que se haya realizado el último paso de purificación.
• Debe estar pura. Se deben considerar, al menos, dos criterios de pureza (electroforesis en geles de poliacrilamida desnaturalizantes, exclusión molecular, y/o espectrometría de masas).
• Debe de estar plegada. Un espectro de dicroísmo circular en el UV-Lejano es suficiente.
• Si se trata de una enzima es conveniente demostrar que está activa.
• La proteína debe estar monodispersa, técnicas como SEC-MALS o DLS son ideales para determinar que la muestra no esté agregada en solución.
• El IQ cuenta también con infraestructura adecuada para verificar todos estos puntos en caso de que el usario lo solicite.

  ¿Y si no tengo acceso a las técnicas para caracterizar a mi muestra?

  En el LANEM podemos realizar estas pruebas antes de poner la proteína a cristalizar. Sin embargo, es necesario tener mayor cantidad de la misma, lo más pura posible y estos servicios tienen un costo adicional.

  Quiero obtener la estructura de mi proteína con un ligando. ¿Cómo le hago?

  Es necesario que los requerimientos del proyecto sean conocidos por los integrantes del LANEM, así podremos asesorarte mejor sobre como obtener la estructura de tu proteína en presencia del ligando requerido. Es preferible tener información previa de constantes de asociación o disociación de la proteína y el ligando, o tener evidencia de que interactúan de manera estable.

  ¿En cuánto tiempo tendré mi estructura?

  La obtención de la estructura final depende de cada caso en particular. Principalmente dependerá de las características de la muestra, pureza, estabilidad, homogeneidad, flexibilidad, entre otras. Algunas proteínas dan lugar a cristales no adecuados para obtener la estructura usando técnicas de difracción de rayos X, en estos casos la optimización de las condiciones de cristalización es necesaria. Una vez obtenidos los cristales adecuados y los datos de difracción de rayos X óptimos se requiere un periodo 1 a 6 meses para tener la estructura final.

  ¿Cuáles son los servicios que ofrece el LANEM-IQ?

  Montado de pruebas de cristalización de macromoléculas biológicas, solubles y de membrana. Caracterización y optimización de los cristales. Colecta de datos de difracción de rayos X. Determinación de estructuras cristalográficas y validación de las mismas.