Servicios QSAR del IQ. Coordinar, mantener y optimizar los servicios QSAR ofrecidos por el Instituto de Química a empresas externas (agroquímica y farmacia) y a entidades dentro y fuera de la UNAM.
Modelos de predicción de actividad biológica. Realizar estudios de relación estructura-actividad cuantitativa para la generación de modelos de predicción de actividad toxicológica de pesticidas usando metodologías de aprendizaje de máquina (machine learning). Diseñar, crear y manejar bases de datos moleculares de pesticidas de origen natural y sintético para el desarrollo de modelos de predicción de actividad y toxicidad.
Servicios quimioinformáticos. Colaboración con investigadores del Instituto de Química y otras entidades en proyectos que involucren la predicción de propiedades estructurales, fisicoquímicas, y/o de actividades.
Cursos QSAR. Organizar cursos enfocados a metodologías QSAR.
Asignaturas Impartidas a Nivel Licenciatura
Toxicología, Facultad de Química, UNAM. Curso Práctico.
Farmacognosia, Facultad de Química, UNAM.
Probabilidad y Estadística, Escuela Nacional de Estudios Superiores Mérida, UNAM.
Metodología de la Investigación, Escuela Nacional de Estudios Superiores Mérida, UNAM.
Matemáticas II, Escuela Nacional de Estudios Superiores Mérida, UNAM.
Toxicología Computacional, Facultad de Química, Universidad Autónoma de Yucatán, Mérida Yucatán.
Asignaturas Impartidas a Nivel Posgrado
Herramientas de Modelado Molecular. Curso Teórico-Práctico.
Miembro del Sistema Nacional de Investigadores, Área I Biología y Química Nivel 1 (2016 – 2021)
Miembro del Sistema Nacional de Investigadores, Área I Biología y Química. Nivel 2 (2022 – 2026)
Rosas-Cruz, M; Madariaga-Mazón A; García-Mejía, CD; Hernández-Vázquez, E; Gómez-Velasco, H; Jiménez-Faraco, E; Farías-Gaytán, RS; Hermoso, JA; Martínez-Caballero, S.* Identification of Potential Inhibitors of Mycobacterium tuberculosis Amidases: An Integrated In Silico and Experimental Study. ACS Omega 2024, 9(46), 46461-46471. https://doi.org/10.1021/acsomega.4c07964.
Daniela Rebollar-Ramos, Berenice Ovalle-Magallanes, Huzefa A. Raja, Mariano Jacome-Rebollo, Mario Figueroa, Claudia Tovar-Palacio, Lilia G. Noriega, Abraham Madariaga-Mazón, Rachel Mata. “Antidiabetic Potential of a Trimeric Anthranilic Acid Peptide Isolated from Malbranchea flocciformis”. Chemical & Biodiversity. 2024, 21, e202301602. (Impact Factor 2.8)
Emma Maldonado, Areli Mineros, Oscar D Torres, Berenice Ovalle-Magallanes, Abraham Madariaga-Mazón, Ana L Pérez-Castorena, Mahinda Martínez. “Lipase inhibitory activity of constituents of Physalis glutinosa and Physalis latiphysa”. Medicinal Chemistry Research. 2023 (2), 2505–2515. (Impact factor 2.6).
Miriam Díaz-Rojas, Martin González-Andrade, Rodrigo Aguayo-Ortiz, Rogelio Rodríguez-Sotres, Araceli Pérez-Vásquez, Abraham Madariaga-Mazón, Rachel Mata. “Discovery of inhibitors of protein tyrosine phosphatase 1B contained in a natural products library from Mexican medicinal plants and fungi using a combination of enzymatic and in silico methods”. Front Pharmacol. 2023; 14:1281045. (Impact factor 5.6).
Abraham Madariaga-Mazón*, José J Naveja, Arturo Becerra, José Alberto Campillo-Balderas, Ricardo Hernández-Morales, Rodrigo Jácome, Antonio Lazcano, Karina Martinez-Mayorga. “Subtle structural differences of nucleotide analogs may impact SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase and exoribonuclease activity”. Computational and Structural Biotechnology Journal 2022 (20) 5181-5192. (Impact Factor 7.21)
Araceli Pérez-Vásquez, Miriam Díaz-Rojas, Erika V Castillejos-Ramírez, Alejandra Pérez-Esquivel, Yullet Montaño-Cruz, Isabel Rivero-Cruz, Rafael Torres-Colín, Martin González-Andrade, Rogelio Rodríguez-Sotres, José Alberto Gutiérrez-González, Abraham Madariaga-Mazón, Rachel Mata. “Protein tyrosine phosphatase 1B inhibitory activity of compounds from Justicia spicigera (Acanthaceae)”. Phytochemistry 2022 (23) 113410. (Impact Factor 4.07)
R. Bruno Hernández-Alvarado, Abraham Madariaga-Mazón, Fernando Cosme-Vela, Andrés F. Marmolejo-Valencia, Adel Nefzi and Karina Martinez-Mayorga. “Encoding mu-opioid receptor biased agonism with interaction fingerprint”. Journal of Computer Aided Molecular Design. 2021. 35(11):1081-1093. (Impact Factor 3.69)
Marmolejo-Valencia, A. F., Madariaga-Mazon, A., Martinez-Mayorga, K. “Bias-inducing allosteric binding site un mu-opioid receptor signaling” SN Applied Sciences. 2021. Volume 3. 566
Rosas-Jimenez, J.G., Garcia-Revilla, M.A., Madariaga-Mazon, A., Karina Martinez-Mayorga. “Predictive Global Models of Cruzain Inhibitors with Large Chemical Coverage”. ACS Omega. 2021. 16; 6(10): 6722–6735. (Impact Factor 3.51)
Madariaga-Mazón, A.*, Naveja, J., Medina-Franco, J.L., Colima-Noriega, K.O., Martínez-Mayorga, K. “DiaNat-DB: A Molecular Database of Antidiabetic Compounds from Medicinal Plants”. RSC Advances. 2021. 11, 5172-5178. (Impact Factor 3.25)
Hernández-Alvarado, R.B., Madariaga-Mazón, A., Ortega, A., K. Martínez-Mayorga. “DARK Classics in Chemical Neuroscience: Salvinorin A”. ACS Chemical Neuroscience, 2020. 11, 23, 3979–3992. (Impact Factor 4.42)
Jesús Naveja-Romero, Abraham Madariaga-Mazón, Francisco Flores-Murrieta, Julio Granados-Montiel, Marco A. Maradiaga-Ceceña, Víctor Duarte-Alaniz, Maricruz Maldonado-Rodríguez, Jazmín García-Morales, Juan Pablo Senosiain-Peláez, Raúl García Salgado-López, Joaquín Zúñiga, Karina Martinez-Mayorga. “Union is strength: antiviral and anti-inflammatory drugs for COVID-19”. Drug Discovery Today. 2020. 26(1):229-239. (Impact Factor 7.85)
Karina Martínez-Mayorga, Abraham Madariaga-Mazón, José L. Medina-Franco, GM Maggiora. 2020. The impact of chemoinformatics on drug discovery in the pharmaceutical industry. Expert Opinion in Drug Discovery. 15(3):293-306. (Impact Factor 4.60)
Abraham Madariaga-Mazón, Ricardo Hernández-Alvarado, Karla Olivia Noriega-Colima, Adriana Osnaya-Hernández, Karina Martinez-Mayorga. Toxicity of secondary metabolites. Physical Sciences Reviews, ISSN (Online) 2365-659X, DOI: https://doi.org/10.1515/psr-2018-0116.
Ricardo Hernández-Alvarado, Abraham Madariaga-Mazón, Karina Martinez-Mayorga. Prediction of toxicity of secondary metabolites. Physical Sciences Reviews, ISSN (Online) 2365-659X, DOI: https://doi.org/10.1515/psr-2018-0107.
Abraham Madariaga-Mazón, Adriana Osnaya-Hernández, Arni Chávez-Gómez, Juan Carlos García-Ramos, Fernando Cortés-Guzmán, Durbis Javier Castillo-Pazos, Karina Martínez-Mayorga. 2019. Distribution of toxicity values across different species and modes of action of pesticides from PESTIMEP and PPDB databases. Toxicology Research. 8(2) 146-156. (Impact Factor 3.52)
Juan Carlos Gómez-Verjan, Nadia Alejandra Rivero-Segura, Edgar Estrella-Parra, Ruth Rincón-Heredia, Abraham Madariaga-Mazón, Edgar Flores-Soto, Mario González-Meljem, Marco Cerbón, Ricardo Reyes-Chilpa. 2019. Network Pharmacology Uncovers Anticancer Activity of Mammea-Type Coumarins from Calophyllum Brasiliense. Planta medica. 85(01), 14-23. (Impact Factor 3.35)
Gomez-Jimenez, G., Gonzalez-Ponce, K., Castillo-Pazos, D., Madariaga-Mazon, A., Barroso-Flores, J., Cortes-Guzman, F., Martinez-Mayorga, K. 2018. The OECD Principles for (Q)SAR Models in the Context of Knowledge Discovery in Databases (KDD). Advances in Protein Chemistry and Structural Biology. Academic Press. pp 1-31. (Impact Factor 3.78)
Madariaga-Mazón, A., Marmolejo-Valencia, A. F., Yangmei, L., Houghten, R., Martínez-Mayorga, K. 2017. Mu opioid receptor biased agonists: Safer and painless Discovery of analgesics? Drug Discovery Today. 22(11), 1719-1729. (Impact Factor 7.85)
Espinoza-Vázquez, A., Rodríguez-Gómez, F.J., Mata, R., Madariaga-Mazón, A., Ángeles-Beltrán, D. 2017. Perezone as corrosion inhibitor for AISI 1018 steel immersed in NaCl saturated with CO2. Journal of Solid State Electrochemistry. 21(6), 1687-1697. (Impact Factor 2.43)
Martínez, A. L., Madariaga-Mazón, A., Rivero-Cruz, I., Bye, R., Mata, R. 2016. Antidiabetic and Antihyperalgesic Effects of a Decoction and Compounds from Acourtia thurberi. Planta Medica. 83(6), 534-544. (Impact Factor 3.35)
Rangel-Grimaldo, M., Rivero-Cruz, I., Madariaga-Mazón, A., Figueroa, M., Mata, R. 2017. α‑Glucosidase Inhibitors from Preussia minimoides. Journal of Natural Products. 80(3), 582-587. (Impact Factor 4.05)
Verastegui-Omaña, B., Rebollar-Ramos, D., Pérez-Vásquez, A., Martínez, A.L., Madariaga-Mazón, A., Flores-Bocanegra, L., Mata, R. 2017. α-Glucosidase Inhibitors from Malbranchea flavorosea. Journal of Natural Products. 80 (1), 190-195. (Impact Factor 4.05)
González-Andrade, M., Rodríguez-Sotres, R., Madariaga-Mazón, A., Rivera-Chávez, J., Mata, R., Sosa-Peinado, A., Del Pozo-Yauner, L., Arias-Olguín, I. 2016. Insights into molecular interactions between CaM and its inhibitors from molecular dynamics simulations and experimental data. Journal of Biomolecular Structure and Dynamics. 34 (1) 78-91. (Impact Factor 1.94)
Madariaga-Mazón, A., Hernández-Abreu, O., Estrada-Soto, S., Mata, R. 2015. Insights on the vasorelaxant mode of action of malbrancheamides. Journal of Pharmacy and Pharmacology. 67 (4) 551-558. (Impact Factor 3.76)
Madariaga-Mazón, A., González-Andrade, M., Toriello, C., Navarro-Barranco, H., Mata, R. 2015. Potent anti-calmodulin activity of cyclotetradepsipeptides isolated from Isaria fumosorosea using a newly designed biosensor. Natural Product Communications. 10 (1) 113-116. (Impact Factor 0.96)
Mata, R., Figueroa, M., González-Andrade, M., Rivera-Chávez, J.A., Madariaga-Mazón, A., Del Valle, P. 2015. Calmodulin inhibitors from natural sources: an update. Journal of Natural Products, 78 (3) 576-586. (Impact Factor 4.05)
Madariaga-Mazón, A., González-Andrade, M., González, M.D.C., Glenn, A.E., Cerda-García-Rojas, C.M., Mata, R. 2013. Absolute configuration of acremoxanthone C, a potent calmodulin inhibitor from Purpureocillium lilacinum. Journal of Natural Products, 76 (8) 1454-1460. (Impact Factor 4.05)
González-Andrade, M., Mata, R., Madariaga-Mazón, A., Rodríguez-Sotres, R., Del Pozo-Yauner, L., Sosa-Peinado, A. 2013. Importance of the interaction protein-protein of the CaM-PDE1A and CaM-MLCK complexes in the development of new anti-CaM drugs. Journal of Molecular Recognition, 26 (4) 165-174. (Impact Factor 2.03)
Figueroa, M., González-Andrade, M., Sosa-Peinado, A., Madariaga-Mazón, A., Del Río-Portilla, F., Del Carmen González, M., Mata, R. 2011. Fluorescence, circular dichroism, NMR, and docking studies of the interaction of the alkaloid malbrancheamide with calmodulin. Journal of Enzyme Inhibition and Medicinal Chemistry, 26 (3) 378-385. (Impact Factor 4.77)
Técnico Académico Asociado "C"
Correo: amadariaga@iquimica.unam.mx
Tel. +(52) 99 93 41 08 60
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