1962 – † Dr. Jesús Romo Armería, Premio de Investigación en Ciencias Exactas, otorgado por la Academia Mexicana de Ciencias.
1965 – † Dr. Jesús Romo Armería, Premio Nacional de Química Andrés Manuel del Río, otorgado por la Sociedad Química de México.
1968 – Dr. Alfonso Romo de Vivar y Dr. Fernando Walls Armijo, Premio de Investigación en Ciencias Exactas, otorgado por la Academia Mexicana de Ciencias.
1975 – Dr. Alfonso Romo de Vivar, Premio Banamex de Ciencia y Tecnología, Diploma Especial.
1977 – Dr. Alfonso Romo de Vivar, Premio Nacional de Química Andrés Manuel del Río, otorgado por la Sociedad Química de México.
1977 – Dr. Alfonso Romo de Vivar, Premio Nacional de Química y Ciencias Farmacéuticas, otorgado por el Gobierno de México.
1979 – † Dr. Fernando Walls Armijo, Premio Nacional de Química Andrés Manuel del Río, otorgado por la Sociedad Química de México.
1985 – † Dr. Raúl Cetina Rosado, Premio Nacional de Química Andrés Manuel del Río, otorgado por la Sociedad Química de México.
1985 – † Dr. Tirso Ríos Castillo, Premio Nacional de Química Andrés Manuel del Río, otorgado por la Sociedad Química de México.
1988 – † Dra. Lydia Rodríguez Hahn, Premio Nacional de Química Andrés Manuel del Río, otorgado por la Sociedad Química de México.
1986 – † Jacobo Gómez Lara, Premio Nacional de Química Andrés Manuel del Río, otorgado por la Sociedad Química de México.
1987 – Dr. Alfonso Romo de Vivar Romo, Premio Universidad Nacional en el área de Ciencias Naturales, otorgado por la Universidad Nacional Autónoma de México.
1989 – Dr. Barbarín Arreguín Lozano, Premio Nacional de Química Andrés Manuel del Río, otorgado por la Sociedad Química de México.
1989 – Dr. Manuel Soriano García, Premio Nacional de Química Andrés Manuel del Río, otorgado por la Sociedad Química de México.
1989 – Dr. Guillermo Delgado Lamas, Distinción Universidad Nacional para Jóvenes Académicos, otorgado por la Universidad Nacional Autónoma de México.
1990 – Dr. Luis Ángel Maldonado Graniel, Premio Nacional de Química Andrés Manuel del Río, otorgado por la Sociedad Química de México.
1990 – Dr. Alfonso Romo de Vivar Romo, Premio IOCD-Syntex para la Excelencia de la Química en México.
1991 – Dr. Eduardo Díaz Torres, Premio Nacional de Química Andrés Manuel del Río, otorgado por la Sociedad Química de México.
1991 – Dr. Alfonso Romo de Vivar Romo, Premio Aguascalientes de Ciencia y Tecnología, otorgado por el Gobierno del Estado de Aguascalientes.
1991 – Dr. Federico A. García Jiménez, Premio Martín de la Cruz, otorgado por el Consejo de Salubridad General de la Secretaría de Salud.
1992 – Dr. Guillermo Delgado Lamas, Premio de Investigación en Ciencias Exactas, otorgado por la Academia Mexicana de Ciencias.
1993 – Dr. Gabriel Eduardo Cuevas González Bravo, Premio Weizmann en Ciencias Exactas, otorgado por la Academia Mexicana de Ciencias.
1993 – Dr. Raúl Enríquez Habib, Premio Nacional de Química Andrés Manuel del Río, otorgado por la Sociedad Química de México.
1993 – Dr. Eduardo Díaz Torres, Presea “Estado de México” en el área de Ciencias, otorgada por el Gobierno del Estado de México.
1995 – Dr. Mario Molina Henríquez, obtuvo el Premio Nobel de Química.
1996 – Dr. Leovigildo Quijano, Premio Nacional de Química Andrés Manuel del Río, otorgado por la Sociedad Química de México.
1996 – Dr. Tirso Ríos Castillo y Dr. Leovigildo Quijano, Premio Universidad Nacional en el área de Investigación en Ciencias Naturales, otorgado por la Universidad Nacional Autónoma de México.
1996 – † Dr. Raymundo Cruz Almanza, Presea “Estado de México” en el área de Ciencias, otorgada por el Gobierno del Estado de México.
1997 – † Dra. Lydia Rodríguez Hahn, Premio Universidad Nacional en el área de Investigación en Ciencias Naturales, otorgado por la Universidad Nacional Autónoma de México.
1998 – Dr. Francisco Lara Ochoa. Premio "Martín de la Cruz", 1998 (que otorga la Secretaría de Salud).
1999 – Dr. Manuel Soriano García, Premio Nacional de Ciencia y Tecnología de Alimentos, otorgado por Industria Coca Cola.
1999 – M. en C. Carmen Márquez Alonso, Dr. Francisco Lara Ochoa, M. en C. Baldomero Esquivel Rodríguez y Dra. Rachel Mata Essayag, Premio de la Cámara Nacional de la Industria Editorial Mexicana al Arte Editorial 1999 en la división Libros de Ciencias Biomédicas, por el libro: Plantas medicinales de México II, Composición, Usos y Actividad Biológica, Editado por la Universidad Nacional Autónoma de México.
2000 – Dr. Mariano Martínez Vázquez, Premio “Martín de la Cruz”, otorgado por la Academia Mexicana de Medicina Tradicional A. C.
2002 – Dr. Gabriel Cuevas González Bravo, Premio de Investigación en Ciencias Exactas, otorgado por la Academia Mexicana de Ciencias
2003 – Dra. Ofelia Collera Zúñiga, Reconocimiento Sor Juana Inés de la Cruz, otorgado por la Universidad Nacional Autónoma de México.
2003 – Dr. Gabriel Cuevas González Bravo, Distinción Universidad Nacional para Jóvenes Académicos, otorgado por la Universidad Nacional Autónoma de México.
2003 – Dr. Guillermo Delgado Lamas, Premio Nacional de Química Andrés Manuel del Río, en el área de Investigación, otorgado por la Sociedad Química de México
2004 – † Dr. Armando Cabrera Ortiz, Premio Nacional de Química Andrés Manuel del Río en el área de Docencia, otorgado por la Sociedad Química de México
2004 – Dr. Manuel de Jesús Salmón Salazar, Premio Nacional de Química Andrés Manuel del Río en el área de Investigación, otorgado por la Sociedad Química de México.
2005 – † Dr. Tirso Ríos Castillo, Premio Nacional de Divulgación de la Ciencia Alejandra Jaidar, otorgado por la Sociedad Mexicana de Divulgación de la Ciencia y la Tecnología.
2005 – Dr. Cecilio Álvarez Toledano, Premio Nacional de Química Andrés Manuel del Río en el área de Investigación, otorgado por la Sociedad Química de México.
2005 – M. en C. Lucía del Carmen Márquez Alonso – Reconocimiento Sor Juana Inés de la Cruz, otorgado por la Universidad Nacional Autónoma de México.
2006 – Dra. Adela Rodríguez Romero – Reconocimiento Sor Juana Inés de la Cruz, otorgado por la Universidad Nacional Autónoma de México.
2007 – M. en C. Emma Maldonado Jiménez – Reconocimiento Sor Juana Inés de la Cruz, otorgado por la Universidad Nacional Autónoma de México.
2007 – M. en C. Ana Lidia Pérez Castorena, Reconocimiento Sor Juana Inés de la Cruz, otorgado por la Universidad Nacional Autónoma de México
2007 – Dr. Roberto Martínez, asesor de tesis, Premio Mejor Tesis a Nivel Maestría, otorgado por la Sociedad Química de México. Autor: Paul Eduardo Reyes Gutiérrez.
2008 – Dr. Alfonso Romo de Vivar Romo, Premio Martín de la Cruz, otorgada por el Consejo de Salubridad General de la Secretaría de Salud.
2008 – Dr. Jesús Valdés Martínez Jesús, asesor de tesis, Premio Mejor Tesis a nivel Doctorado, otorgado por la Sociedad Química de México. Autor: Sergio Martínez Vargas.
2009 – Dr. Cecilio Álvarez Toledano, Premio Universidad Nacional en Investigación en Ciencias Exactas, otorgado por la Universidad Nacional Autónoma de México.
2009 – Dr. Bernardo Frontana Uribe, Premio Anual de la Academia de Ciencias de Cuba 2008, por el artículo “Estudios de la composición química de propóleos cubanos”.
2009 – Dr. David Morales Morales, asesor de tesis, Premio a la Mejor Tesis de Licenciatura, otorgado por la Sociedad Química de México, autor: Quím. Marco César Corona Rodríguez
2009 – Q.F.B. María del Rocío Patiño Maya - Reconocimiento Sor Juana Inés de la Cruz, otorgado por la Universidad Nacional Autónoma de México.
2010 – Lic. Sandra Rosas Poblano – Reconocimiento Sor Juana Inés de la Cruz, otorgado por la Universidad Nacional Autónoma de México.
2010 – Dr. Gabriel Cuevas González Bravo, asesor de tesis, Premio Mejor Tesis a nivel Doctorado, otorgado por la Sociedad Química de México. Autora: Karla Elizabeth Ramírez Gualito.
2010 – Dr. Raymundo Cea Olivares, Premio Nacional de Química Andrés Manuel del Río en el área de Investigación, otorgado por la Sociedad Química de México.
2010 – Dr. Luis Demetrio Miranda Gutiérrez, Distinción Universidad Nacional para Jóvenes Académicos en el Área de Ciencias Naturales, otorgado por la Universidad Nacional Autónoma de México.
2010 - Dr. Cecilio Álvarez y Toledano, Premio Universitario a la Investigación Socio-Humanística, Científica y Tecnológica UASLP 2010.
2011 - Dr. Roberto Martínez, Premio Nacional de Química Andrés Manuel del Río en el área de Investigación, otorgado por la Sociedad Química de México.
2012 - Dr. Manuel Soriano García. Premio Ciudad Capital: Heberto Castillo Martínez en Innovación para Mexicanos y Mexicanas destacados, edición 2012. Premio otorgado por el Gobierno del Distrito Federal, a través del Instituto de Ciencia y Tecnología, Ciudad de México, 6 de noviembre del 2012.
2013 - Dr. Alfredo Ortega, Premio Nacional de Química Andrés Manuel del Río en el área de Investigación, otorgado por la Sociedad Química de México.
2014 - M. en C. Amira Arciniegas Arciniegas.Reconocimiento "Sor Juana Inés de la Cruz".
2014 - Dr. Manuel Soriano García, el Premio Nacional del emprendedor en la categoría Microempresa.
2015 - M.en C. Ma. Teresa Ramírez Apan. Reconocimiento "Sor Juana Inés de la Cruz".
2015 - Dr. Vojtech Jancik obtuvo el Reconocimiento Distinción Universidad Nacional para Jóvenes Académicos.
2015 - Dr. Luis Demetrio Miranda Gutiérrez, Premio Cátedra Marcos Moshinsky.
2016 - Dr. Francisco Lara Ochoa. Premio Nacional de Química, "Andrés Manuel del Río", otorgado por la Sociedad Química de México, 2016.
2017 - Dr. Francisco Lara Ochoa. Premio al Mérito Académico otorgado por la Asociación Autónoma del Personal Académico de la UNAM, 2017.
2018 - Dra. María Isabel Chávez Uribe. Reconocimiento "Sor Juana Inés de la Cruz".
2019 - Dra. Mónica Mercedes Moya Cabrera. Reconocimiento "Sor Juana Inés de la Cruz".
2019 - Dra. Ana Sofía Varela Gasque, fue nombrada una de las 15 jóvenes científicas más prometedoras de todo el mundo (International Rising Talents) por la UNESCO y Fundación L'Oréal.
2019 - Dr. Luis Demetrio Miranda Gutiérrez, Premio Nacional de Química Andrés Manuel del Río en el área de Investigación, otorgado por la Sociedad Química de México.