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Dr. Enrique García Hernández

Instituto de Química, UNAMDr. Enrique García Hernández
Instituto de Química, UNAMDr. Enrique García Hernández
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Departamento de Química de Biomacromoléculas

Dr. Enrique García Hernández/ Investigador

Resumen Académico

Doctorado en Ciencias Químicas, Universidad Autónoma Metropolitana-Iztapalapa (1997). Maestría en Biología Experimental, Universidad Autónoma Metropolitana-Iztapalapa (1994). Licenciatura en Biología, Universidad Nacional Autónoma de México (1990).

Laboratorio /Biomacromoléculas

CV en inglés

Líneas de Investigación

Reconocimiento molecular y estabilidad estructural de proteínas:

Nuestra línea de investigación persigue profundizar en la comprensión de los determinantes del plegamiento/ensamble y del reconocimiento molecular de proteínas. Además, desarrollamos una vertiente sobre el diseño in silico de moléculas tipo fármaco para la inhibición de proteínas de relevancia farmacológica.

Docencia

CURSOS NIVEL POSGRADO:

- Plegamiento de Proteínas y Reconocimiento Molecular.

- Bases Moleculares del Reconocimiento Proteína-Ligando y su Aplicación en el Diseño de  Fármacos.

- Posgrado en Ciencias Bioquímicas, UNAM.

CURSOS NIVEL LICENCIATURA:

De los Genes a la Función de las Proteínas (I-IV). Facultad de Ciencias, UNAM.

ALUMNOS GRADUADOS:
7 de doctorado, 5 de maestría y 10 de licenciatura.

TESIS DE DOCTORADO:
1. Desarrollo de un modelo energético-estructural para estimar el valor del DELTACp en el reconocimiento proteína-carbohidrato. Eneas Alejandro Chavelas Adame. Doctorado en Ciencias Bioquímicas, UNAM Septiembre de 2008.

2. Caracterización termodinámica de la formación del dímero de la β-lactoglobulina. Martiniano Bello Ramírez. Doctorado en Ciencias Bioquímicas, UNAM. Mayo de 2010.

3. Plegamiento y homodimerización de la aglutinina de germen de trigo. María del Carmen Portillo Téllez. Doctorado en Ciencias Biomédicas, UNAM. Septiembre de 2011.

4. Caracterización energética de la asociación de nucleótidos de adenosina con la subunidad β de la ATP-sintasa de Bacillus PS3. M. en C. Nancy O. Pulido Mayoral. Doctorado en Ciencias Bioquímicas, UNAM. Diciembre de 2011.

5. Bases energético-estructurales de reconocimiento de ligandos por la β-lactoglobulina. Gabriel Gutiérrez Magdaleno. Doctorado en Ciencias Biomédicas, UNAM. Votos aprobatorios de jurado emitidos. Octubre de 2013.

6. Estudio computacional del cambio conformacional de la subunidad no catalítica F1-a de la ATP-sintetasa mediante dinámica molecular. Otto Hahn Herrera. Doctorado en Ciencias Químicas. UNAM. Noviembre 2016.

7. Purificación y caracterización termodinámica de la subunidad α y el núcleo catalítico del sector F1-atpasa de la ATP-sintasa del termófilo Geobacillus kaustophilus. Guillermo Salcedo Barrientos. Doctorado en Ciencias Bioquímicas, UNAM. Octubre 2018.

8. Bases energéticas del reconocimiento de nucleótidos de guanina por la GTPasa Efl1 involucrada en la maduración ribosomal de Saccharomyces cerevisiae. Christian Axel Luviano Jardón. Doctorado en Ciencias Biomédicas, UNAM. 28 junio 2019.

9. Producción recombinante y caracterización biofísica de la aglutinina de germen de trigo y sus cuatro dominios aislados: en búsqueda de elucidar las bases de su estabilidad estructural y reconocimiento de ligandos. Eduardo Leyva Hernández. Doctorado en Ciencias Bioquímicas, UNAM. 4 octubre 2019.

Existe la disponibilidad para aceptar nuevos alumnos que deseen desarrollar su tesis de licenciatura, maestría o doctorado, al igual que aquellos que deseen realizar servicio social o estancia posdoctoral. Por lo general, contamos con becas para tesis de licenciatura mediante apoyos de proyecto CONACYT y PAPIIT, mientras que para los estudiantes de posgrado, las becas las otorga CONACYT a través del Programa de Excelencia de Posgrado al cual pertenecen los Programas en Ciencias Bioquímicas y Ciencias Biomédicas, de los cuales soy tutor acreditado.

 

Distinciones
  • Medalla Gabino Barreda (UNAM) por estudios de Licenciatura.
  • Medalla al Mérito Universitario (UAM) por estudios de Maestría.
  • Medalla al Mérito Universitario (UAM) por estudios de Doctorado.
  • Sistema Nacional de Investigadores Nivel II.
  • PRIDE Nivel “D”.

 

Publicaciones recientes/relevantes
  • Bello, M., Pérez-Hernández, G., Fernández-Velasco, D. A., Arreguín-Espinosa, R., García-Hernández, E. (2008) Energetics of protein homodimerization: effects of water sequestering on the formation of β-lactoglobulin dimer. Proteins: Struct., Funct, Bioinf. 70: 1475-1487. 
  • Pulido, N. O., Chavelas, E. A., Turner, F., García-Hernández, E. (2008) Current applications of isothermal titration calorimetry to the study of protein complexes. En: Advances in Protein Physical Chemistry, García-Hernández, E., Fernández-Velasco, D. A., Eds. Transworld Research Network, pp. 115-138.
  • Chavelas, E. A., García-Hernández, E. (2009) Heat capacity changes in carbohydrates and protein-carbohydrate complexes. Biochem. J. 420: 239-247.
  • Pulido, N.O., Salcedo, G., Pérez-Hernández, G., José-Núñez, C., Velázquez-Campoy, A., García-Hernández, E. (2010) Energetic effects of magnesium in the recognition of adenosine nucleotides by the F1-ATPase β Biochemistry. 49: 5258–5268. 
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  • Portillo-Téllez, M. C., Bello, M., Salcedo, G., Gutiérrez, G., Gómez-Vidales, V., García-Hernández, E. (2011) Folding and homodimerization of wheat germ agglutinin. Biophys. J. 101: 1423–1431.
  • Bello, M., Gutiérrez, G., García-Hernández, E. (2012) Structure and dynamics of β-lactoglobulin in complex with dodecyl sulfate and laurate: A molecular dynamics study. Biophys. Chem. 165–166: 79–86.
  • Gutiérrez, G., Bello, M., Portillo-Téllez, M. C., Rodríguez-Romero, A., García-Hernández, E. (2013) Ligand-binding and self-association cooperativity of β-lactoglobulin. J. Mol. Recognit. 26: 67-75.
  • Salcedo, G., Cano-Sánchez, P., Tuena de Gómez Puyou, M., Velázquez-Campoy, A.,García-Hernández, E. (2014) Isolated noncatalytic and catalytic subunits of F1-ATPase exhibit similar, albeit not identical, energetic strategies for recognizing adenosine nucleotides. BBA Bioenergetics. 1837: 44-50.
  • Bello, M., García-Hernández, E. (2014) Ligand entry into the calyx of β-lactoglobulin. 101: 744-757. 
  • Castellanos-Mendoza, A., Castro-Acosta, R. M., Olvera, A., Zavala, G., García-Hernández, E., Alagón, A., Trujillo-Roldán, M. A., Valdez-Cruz, N. A. (2014) Influence of pH control in the formation of inclusion bodies during production of recombinant sphingomyelinase-D in Escherichia coli. Cell Fact. 13: 137.
  • Rivera-Nájera, L. Y., Saab-Rincón, G., Battaglia, M., Amero, C., Pulido, N. O., García-Hernández, E., Solórzano, R.M., Reyes, J. L., Covarrubias, A.A. (2014) A group 6 late embryogenesis abundant protein from common bean is a disordered protein with extended helical structure and able to form oligomers. J. Chem. 289: 31995-32009.
  • Pulido, N.O., Silva, D.-A., Tellez, L. A., Pérez-Hernández, G., García-Hernández, E., Sosa-Peinado, A. and Fernández-Velasco, D. A. (2015) Enthalpy optimization in the recognition of basic amino acids by LAOBP, a periplasmic binding protein from Salmonella typhimurium. J. Mol Recognit 28:108-116.
  • Hahn-Herrera, O., Salcedo, G., Barril, X., García-Hernández, E. (2016) Inherent conformational flexibility of F1-ATPase a-subunit. BBA Bioenergetics. 1857: 1392-1402
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    Ruiz-Blanco, Y.B., Agüero-Chapin, G., García-Hernández, E., Álvarez, O., Antunes, A., Green, J. (2017) Exploring general-purpose protein features for distinguishing enzymes and non-enzymes within the twilight zone. BMC Bioinformatics. 18:349.
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  • Luviano, A., Cruz-Castañeda, R., Sánchez-Puig, N.,García-Hernández, E.* (2019) Cooperative energetic effects elicited by the yeast Shwachman-Diamond syndrome protein (Sdo1) and guanine nucleotides modulate the complex conformational landscape of the elongation factor-like 1 (Efl1) GTPase. Biophys. Chem. 247: 13-24(F.I. = 1.9; issn 0301-4622; doi.org/10.1016/j.bpc.2019.02.003).
  • Schulte-Sasse, M., Pardo-Ávila, F., Pulido-Mayoral, N.O., Vázquez-Lobo, A., Costas, M., García-Hernández, E., Rodríguez-Romero, A., Fernández-Velasco, D.A. (2019) Structural, thermodynamic and catalytic characterization of an ancestral triosephosphate isomerase reveal early evolutionary coupling between monomer association and function. FEBS J. 286: 882-900. (F.I. = 4.5;issn 1742-464X; doi:10.1111/febs.14741; doi.org/10.1111/febs.14741).
  • Gómez-Velasco, H., Rojo-Domínguez, A., García-Hernández, E.*(2020) Enthalpically-driven ligand recognition and cavity solvation of bovine odorant binding protein. Biophys. Chem. 257: 106315 (F.I. = 1.8; issn 0301-4622; doi:10.1016/j.bpc.2019.106315).
  • Ruiz-Blanco, Y.B., Ávila-Barrientos, L.P., Hernández-García, E., Antunes, A., Agüero-Chapin, G.*, García-Hernández, E.* (2021) Engineering protein fragments via evolutionary and protein-protein interaction algorithms: De novo design of peptide inhibitors for FOF1-ATPsynthase. FEBS Lett. 595(2): 183-194. (F.I. = 4.1, Q1; issn 0014-5793; doi: 10.1002/1873-3468.13988).
  • Labra-Núñez, A., Cofas-Vargas, L.F., Gutiérrez-Magdaleno, G., Gómez-Velasco, H., Rodríguez-Hernández, A., Rodríguez-Romero, A., García-Hernández, E.* (2021) Energetic and structural effects of the Tanford transition on ligand recognition of bovine β-lactoglobulin. Arch. Biophys. Biochem. 699: 108750. (F.I: = 4.0, Q1; issn 0003-9861; doi: 10.1016/j.abb.2020.108750).
  • Valdez-Cruz, N.A.*, García-Hernández, E., Espitia, C., Cobos-Marín, L., Altamirano, C., Bando-Campos, C.G., Cofas-Vargas, L.F., Coronado-Aceves, E.W., González-Hernández, R.A., Hernández-Peralta, P., Juárez-López, D., Ortega-Portilla, P.A., Restrepo-Pineda, S., Zelada-Cordero, P., Trujillo-Roldán, M.A.* (2021) Integrative overview of antibodies against SARS-CoV-2 and their possible applications in COVID-19 prophylaxis and treatment. Microb. Cell Fact. 20:88. (F.I. = 4.2, Q1; issn 1475-2859, doi: 10.1186/s12934‑021‑01576).