Dra. Corina-Diana Ceapă

Enseñanza a nivel de posgrado:

Curso: "Introducción a la bioinformática con enfoque en genómica comparativa y minería de datos en procariontes"

Presentado en las escuelas de posgrado (de Química y Biología), Instituto de Química (CI) y Facultad de Química (CF) desde 2020 a la fecha, alrededor de 55 alumnos por semestre (64 horas/semestre).

Supervisión directa de estudiantes:

Proyectos de estudiantes de la Universidad Wageningen:

2010 - Marie Jose Hendriks MSc: "Evaluación de la capacidad de adhesión, actividad inmunomoduladora y actividad antagonista frente a enteropatógenos de cepas de Lactobacillus rhamnosus".

2012 - Maestría en Ciencias de Margorzata Magdalena Dzielska: "Impacto de los componentes bacterianos y factores de fermentación en la respuesta del huésped in vitro".

2012 - Maestría en Ciencias de Loo Wee Chia: "Ensayos de mutagénesis de lactobacilos y optimización de PCR".

Tesis de grado UNAM:

2018 - Co-tutor de la Maestría de Stefany Daniela Rodriguez Luna: "Aplicación de la minería del genoma para la detección de compuestos de interés farmacéutico en la cepa NF3 de S. scabrisporus".

Tesis en curso:

Diana Enríquez Vargas BSc: “Aplicaciones de la minería genómica en la identificación de un clúster para la producción de un lantipéptido con potencial importancia farmacéutica”.

Moises Alejandro Alejo Hernandez's BSc: "Caracterización de metabolitos secundarios identificados por minería genómica de nuevos genomas bacterianos".

Reynaldo Villanueva Enríquez BSc: "Aislamiento de bacterias asociadas a plantas y caracterización genética de grupos de metabolitos secundarios endófitos con un enfoque en NRPS".

2008 – Estancia para tesis de Maestría en Glicobiología Estructural a la Unité de Glycobiologie Structurale et Fonctionnelle, USTL Lille 1, Francia (Proyecto Erasmus de la Unión Europea).

2009 – 2013 - Eventos Crosstalk UE - 4 reuniones de red y Escuelas Primavera (INRA, Francia; la Universidad de Aberdeen, Escocia; Universidad de Debrecen, Hungría; la Universidad de

Wageningen, Países Bajos) y 2 talleres (Universidad de Milán y Oslo) - 4 posters y 2 presentaciones orales.

2009 – 2013 - Marie Curie Fellowship, Red de Formación Inicial CrossTalk UE.

2012 – Beca UE-EE.UU, Formación en Bioinformática Marina, proyecto Micro3, Bremen, Alemania.

2012 – Premio a la mejor presentación de póster, Laboratorio de Microbiología, Universidad de Wageningen, Países Bajos.

2016 – Beca DGAPA para una estancia postdoctoral, UNAM, México.

2017 – Premio a la mejor presentación de póster, Congreso SMBB 2017, Puerto Vallarta, México.

2018 – Travel Award, ASM Microbe, Atlanta, USA.

2018 – Ganador de un proyecto de movilidad para jóvenes investigadores de la diáspora, MCT-2018- Bucharest, Romania.

Liderazgo estratégico:

Planes de desarrollo de investigación para el laboratorio MicroIQ, el Grupo de Investigación Antimicrobianos en IQ, el grupo PRONACE AMR (UNAM) y GLACIER (DAAD).

Planificación y materiales, datos e ideas para la campaña de crowdfunding AMR de CI y Fundación UNAM (https://dona.iquimica.unam.mx/).

Contribuciones de la comunidad de investigación:

Editor invitado del Número Especial "Productos Naturales Microbianos", publicado en Molecules (2020), directamente involucrado en 7 reseñas de editores.

Revisiones para revistas indizadas (32):

Applied Microbiology and Biotechnology, 

Frontiers in Microbiology, 

Archives of Microbiology, 

PLOS One, 

BMC Genomics,

Current Microbiology, 

Frontiers in Bioengineering and Biotechnology, 

Frontiers in Cellular and Infection Microbiology, 

Frontiers in Immunology, 

G3: Genes|Genomes|Genetics, 

Natural Product Communications,

Revista Colombiana de Química.

1. Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (CONACYT), para la Dra. Corina-Diana Ceapa, Proyecto número 319816 “Exploración de la “materia oscura microbiana” mediante genómica, para el descubrimiento de nuevos antimicrobianos”, otorgado en 2022.

2. Dirección General de Asuntos del Personal Académico (DGAPA), UNAM, para la Dra. Corina-Diana Ceapa, IA201721 Descubrimiento y validación de antimicrobianos contra bacterias resistentes a antibióticos utilizando minería de genomas. Otorgado por dos años: 2021 - 2022.
3. Fundación UNAM, iniciativa de crowdfunding del Grupo de Investigación en Antimicrobianos (Dra. Corina-Diana Ceapa, Dr. José Rivera Chávez, Dra. Carol Siseth Martínez, Dra. Danai Montalvan, Dr. Armando Hernández, Dr. Eduardo Hernández), “Estudios genómicos de microorganismos resistentes en México”.
4. DAAD Alemania - Centro Alemán-Latinoamericano de Investigación y Capacitación en Infecciones y Epidemiología (GLACIER) - adjudicado a un consorcio de 20 grupos de investigación de la UNAM, para la duración 2022 - 2026.
5. Instituto de Química, UNAM, financiamiento interno, para la Dra. Corina-Diana Ceapa; Implementación y validación de un método de microdilución en caldo de alto rendimiento para probar nuevos compuestos contra patógenos clínicos resistentes a los antibióticos. Otorgado anualmente.

Patente: Lactobacillus rhamnosus and supernatants thereof for inhibition of pathogens. Emitido: Mar30, 2017; Patente emisor y número: US PCT/EP2016/072715.

http://www.unamiradaalaciencia.unam.mx/la_prensa/lista_anteriores_detalle.cfm?vNoCartel=656

https://www.conacyt.gob.mx/index.php/comunicacion/ciencia-para-la-sociedad/956-futuro-cientifico-dra-ceapa?fbclid=IwAR2J9mu3WlmYADdGi7WSnGeata2Fbq7_dHELJ-BSBkp-sg6ZFz8ZMrp7GVE

• Biological Dark Matter Exploration using Data Mining for the Discovery of Antimicrobial Natural Products, Planta Medica, 2022, accepted. Co-autores: Mario Figueroa (FQ), José Rivera Chávez (IQ).

• Maldonado-Carmona N, Vázquez-Hernández M, Patiño Chávez OJ, Rodríguez-Luna SD, Jiménez Rodríguez O, Sanchez S, Ceapă CD: Impact of ∼omics in the detection and validation of potential anti-infective drugs. Curr Opin Pharmacol 2019, 48:1–7.

• Ceapa C, Davids M, Ritari J, Lambert J, Wels M, Douillard FP, Smokvina T, De Vos WM, Knol J, Kleerebezem M: The variable regions of lactobacillus rhamnosus genomes reveal the dynamic evolution of metabolic and host-adaptation repertoires. Genome Biol Evol 2016, 8:1889–1905.

• Guzmán-Trampe S, Ceapa CD, Manzo-Ruiz M, Sánchez S: Synthetic biology era: Improving antibiotic’s world. Biochem Pharmacol 2017, 134 (January):99–113.

• Vazquez-Hernandez M, Ceapa CD, Rodríguez-Luna SD, Rodríguez-Sanoja R, Sánchez S: Draft genome sequence of Streptomyces scabrisporus NF3, an endophyte isolated from Amphipterygium adstringens. Genome Announc 2017, 5:e00556-18.

• Ceapă CD, Vázquez-Hernández M, Rodríguez-Luna SD, Vázquez APC, Suárez VJ, Rodríguez-Sanoja R, Alvarez-Buylla ER, Sánchez S: Genome mining of Streptomyces scabrisporus NF3 reveals symbiotic features including genes related to plant interactions. PLoS One 2018, 13:e0192618.

• Dinu D, Bodea GO, Ceapa CD, Munteanu MC, Roming FI, Serban AI, Hermenean A, Costache M, Zarnescu O, Dinischiotu A: Adapted response of the antioxidant defense system to oxidative stress induced by deoxynivalenol in Hek-293 cells. Toxicon 2011, 57:1023–1032.

• Ceapa C, Wopereis H, Rezaïki L, Kleerebezem M, Knol J, Oozeer R: Influence of fermented milk products, prebiotics and probiotics on microbiota composition and health. Best Pract Res Clin Gastroenterol 2013, 27:139–155.

• Ceapa C, Lambert J, van Limpt K, Wels M, Smokvina T, Knol J, Kleerebezem M: Correlation of Lactobacillus rhamnosus genotypes and carbohydrate utilization signatures determined by phenotype profiling. Appl Environ Microbiol 2015, 81:5458–5470.

LIBRO:

• Phenotypic and genetic diversity of the species Lactobacillus rhamnosus, Corina Ceapă, Wageningen University Press, 2016, ISBN 9789462576285 - 195 p.