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Dra. Karina Martínez

Instituto de Química, UNAMDra. Karina Martínez
Instituto de Química, UNAMDra. Karina Martínez

Departamento de Fisicoquímica

Dr. Karina Martínez/ Investigadora

Resumen Académico

La Dra. Karina Martínez se graduó de la licenciatura en Química de Alimentos en 1998 y del doctorado en Ciencias Químicas en 2005, ambos por la Universidad Nacional Autónoma de México en México D. F. Durante sus estudios de doctorado, realizo una visita de investigación en el Centro de Investigaciones Biológicas del Consejo Superior de Investigaciones Científicas en Madrid, España e impartió clases en la Facultad de Química de la UNAM y en la Universidad La Salle en México, D. F. En Febrero de 2005, la Dra. Martínez se unió al grupo del Profesor Michael F. Brown en la Universidad de Arizona como posdoctorante realizando investigación computacional y experimental en proteínas y lípidos de membrana. En Agosto de 2007, se unió al Instituto Torrey Pines de Estudios Moleculares en Florida como Miembro Asistente.

Laboratorio /Fisicoquímica

CV en inglés

Líneas de Investigación.
  • Su área de especialidad es la Química Biológica Computacional. Sus líneas de investigación actual se centran en estudios de reconocimiento molecular, en la identificación de moléculas bioactivas en bases de datos y en la predicción de toxicidad, todo ello usando métodos computacionales. 


Docencia

Alumnos graduados 

Licenciatura

• Ariadna Irais Ramírez Hernández. Fecha de titulación: 17 de febrero de 2014. 

• Diana Esmeralda Terrazas Álvarez. Fecha de titulación: 10 de febrero de 2014. 

• Verónica Leiva Novoa. Universidad La Salle, México, D. F., graduada en 2004 (asesor técnico)

Posgrado 

•  Andrés Felipe Marmolejo Valencia.  Fecha de titulación: 14 de noviembre de 2016

•  Javier Alejandro Posadas Salgado. Fecha de titulación: 10 de junio 2016


Posdoctorantes

• César Raúl García Jacas. Octubre 2016 – a la fecha

• Abraham Madariaga Mazon. Septiembre 2016 – a la fecha

• Austin B. Yongye. Julio 2008 – Julio 2013. 

• Kendall Byler. Julio 2010 – Enero 2013 

• Thomas Caulfield. Junio 2010 – Junio 2011


Profesor de asignatura
• Toxicología informática, Posgrado en Ciencias Químicas, UNAM.

• Preparación de artículos científicos, Posgrado en Ciencias Químicas, UNAM.

• Reconocimiento molecular. Posgrado en Ciencias Químicas, UNAM.

• Laboratorio de Química General, Facultad de Química, UNAM.

• Química General, Laboratorio de Química Analítica, Laboratorio de Cinética Química, Universidad La Salle, México D. F.

Actividades extracurriculares
• Revisor de Proyectos de Investigación: 
o Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (CONACyT). 
o Austrian Science Fund (FWF). 
o Czech Science Foundation.
• Revisor de diversas revistas científicas.


Distinciones
  • Miembro del Sistema Nacional de Investigadores (SNI-CONACyT), Nivel 2
  • Postulado para la Medalla Alfonso Caso por los estudios de doctorado UNAM, 2005.
  • Profesor destacado, Universidad La Salle, 2004.
  • Presentación del trabajo “Good Mood foods: Some flavors in some foods resemble a prescription mood stabilizer” en el “Press Room” del “244th American Chemical Society National Meeting & Exposition” en Filadelfia, PA con aproximadamente 14,700 notas en linea.
  • Financiamiento otorgado por la “Agricultural and Food Chemistry Division of the American Chemical Society” para participar en el “Young Scientist Award Symposium” Agosto 21, 2012.
  • Financiamiento otorgado por Robertet Flavors, Inc.
  • Beca del CONACyT para los estudios de Maestría y Doctorado en Ciencias Químicas en la UNAM
  • Programa de Apoyo a los Estudios de Postgrado, (PAEP-UNAM), 2003.
Publicaciones recientes/relevantes

 

    • Madariaga-Mazón, A.; Marmolejo-Valencia, A. F.; Li,Y.; Houghten, R. A.; Martínez-Mayorga K. “Biased ligands: A safer and painless discovery of analgesics?” Drug Discovery Today 2017 en revision.
    • Valdés-Martiní, J. R. Marrero-Ponce, Y. García-Jacas, C.R.; Martinez-Mayorga, K.  Barigye,S. J.; Vaz ‘d Almeida, Y. S.; Thi Thu, H. L.; Pérez-Giménez, F.; Morel.C. A. “QuBiLS-MAS, Open Source Multi-Platform Software for Atom- and Bond-based Topological (2D) and Chiral (2.5D) Algebraic Molecular Descriptors Computations” J. Chemoinformatics, 2017 en prensa.
    • Marmolejo-Valencia, A. F.; Martinez-Mayorga, K. “Allosteric Modulation Model of the mu Opioid Receptor by Herkinorin, a potent not alkaloidal agonist” J. Comp. Aided Mol. Design, 2017 en prensa.
    • Martinez-Mayorga K.; Marmolejo-Valencia, A. F.; Cortes-Guzman, F.; García-Ramos, J. C.; Sánchez-Flores, E. I.; Barroso-Flores, J, Medina-Franco, J. L.; Esquivel-Rodriguez, B. “Toxicity Assessment of Structurally Relevant Natural Products from Mexican Plants with Antinociceptive Activity” J. Mex. Chem. Soc. 2017, en prensa.
    • Posada-Salgado, J. A.; Bautista, E.; Cuevas, G.; Martinez-Mayorga, K. “A theoretical biogenesis overview of diterpenes isolated from Salvia microphylla” J. Mol. Model. 2015, 21, 306. doi: 10.1007/s00894-015-2841-8
    • Martinez-Mayorga, K.; Byler, K.; Ramirez-Hernandez, A. I.; Terrazas-Alvares, D. E. “Cruzain inhibitors: Efforts made, current leads and a comprehensive structural outlook of new hits” Drug Discovery Today, 2015, 20, 890 – 898. DOI:10.1016/j.drudis.2015.02.004
    • Leioatts, N.; Mertz, B.; Martínez-Mayorga, K.; Romo, T. D.; Pitman, M. C.; Feller, S. E.; Grossfield, A.; Brown, M. F. “Retinal Ligand Mobility Explains Internal Hydration and Reconciles Active Rhodopsin Structures” Biochemistry 2014, 53, 376-385.
    • Martinez-Mayorga, K. Peppard, T. L.; Lopez-Vallejo, F.; Yongye, A. B.; Media-Franco, J. L. “Systematic Mining of GRAS (Generally Recognized as Safe) Flavor Chemicals for Bioactive Compounds” J. Agric. Food. Chem., 2013, 61, 7507-7514http://dx.doi.org/10.1021/jf401019b
    • Byler, K.; Li, Y.; Houghten, R. A.; Martinez-Mayorga, K. “The Role of Imidazole in Peptide Cyclization by Transesterification: Parallels to the Catalytic Triads of Serine Proteases” Org. Biomol. Chem., 2013, 11 (18), 2979 – 2987. http://dx.doi.org/10.1039/C3OB27464K
    • Struts, A.V.; Salgado, G. F.; Martinez-Mayorga, K.; Brown, M. F. “Retinal Dynamics Underlie Inverse-Agonist to Agonist Switch in Rhodopsin Activation” Nat. Struct. Mol. Biol. 2011, 18, 392-394. http://dx.doi.org/10.1038/nsmb.1982
    • Mahalingam, M.; Martínez-Mayorga, K.; Brown, M. F.; Vogel, R. “Two protonation switches control rhodopsin activation in membranes” Proc. Natl. Acad. Sci., 2008, 105, 17795-17800. http://dx.doi.org/10.1073/pnas.0804541105 PMCID: PMC2584695
    • Martínez-Mayorga, K.; Pitman, M. C.; Groessfield, A.; Feller, S. E.; Brown, M. F. “Retinal Counterion Switch Mechanism in Vision Evaluated by Molecular Simulations” J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 16502-16503. http://dx.doi.org/10.1021/ja0671971 PMID: 17177390
    • Cuevas, G.; Martínez-Mayorga, K.; Fernandez-Alonso, M. del. C.; Jiménez-Barbero, J.; Perrin, C. L.; Juaristi, E.; López-Mora, N. “The Origin of One-Bond C-H Coupling Constants in OCH Fragments: Not Primarily nO ® σ*CH Delocalization” Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 2005, 44, 2360-2364. http://dx.doi.org/10.1002/anie.200461583 PMID: 15761904
    • Martínez-Mayorga, K.; Juaristi, E.; Cuevas, G. “Manifestation of Steroelectronic Effects on the Calculated Carbon-Hydrogen Bond Lengths and One Bond 1JC-H NMR Coupling Constants. Relative Acceptor Ability of the Carbonyl Group (C=O), Thiocarbonil (C=S), and Methylidene (C=CH2) Groups Towards C-H Donor Bonds” J. Org. Chem. 2004, 69, 7266-7276. doi: 10.1021/jo0490200